Feltérképezték a létfontosságú gének kölcsönhatásait a tuberkulózis baktériumában
A Mycobacterium tuberculosis, a tuberkulózis kórokozója továbbra is a világ egyik leghalálosabb fertőző betegséget okozó baktériuma, miközben számos génjének működése és kapcsolatrendszere még tisztázatlan. Ez a hiányos tudás nehezíti a baktérium biológiájának megértését és új gyógyszerek fejlesztését. A kutatók ezért olyan módszert dolgoztak ki, amellyel nagy léptékben vizsgálható, hogyan befolyásolja két gén együttes működésének csökkentése a baktérium túlélését és növekedését.
Az új rendszer két, egymástól függetlenül irányítható vezető RNS-t használó CRISPR-interferencia-platform. A módszer egyidejűleg képes génpárok célzott elnyomására, és a kutatók minden sgRNS-párhoz egyedi vonalkódot rendeltek, hogy az eredmények nagy pontossággal követhetők legyenek. A kombinált génmódosítás hatását az egyes gének külön-külön történő módosításának várható eredményéhez hasonlították. Ha a kettős beavatkozás ettől jelentősen eltért, genetikai kölcsönhatást azonosítottak.
A vizsgálatban először a modellként használt Mycobacterium smegmatis, majd maga a tuberkulózis baktériuma, a M. tuberculosis nélkülözhetetlen génjeit térképezték fel. Az így létrehozott hálózatok ismert biológiai összefüggéseket is visszaadtak, emellett több ezer korábban fel nem ismert kapcsolatot tártak fel. A térképek olyan génkapcsolatokat is azonosítottak, amelyek gyógyszercélpontokhoz kötődnek, köztük potenciálisan szinergikus kombinációkat. Az AlphaFold3 segítségével minden génpárhoz fehérje–fehérje kölcsönhatási előrejelzéseket készítettek, és ezek alapján a genetikai kapcsolatok egy része közvetlen fizikai társulásra vezethető vissza. A kiválasztott eredmények kísérleti ellenőrzése új biológiai összefüggéseket és kombinációs terápiás lehetőségeket is megerősített.
Folytasd az appban — szavazz és szólj hozzá ➔